Nach der Ausrufung des Ausnahmezustands und der Sperrung des israelischen Luftraums für Starts und Landungen durch die Sicherheitsbehörden hat EL AL die Annullierung aller Flüge angekündigt. Kunden, deren Flüge aufgrund der Sicherheitslage gestrichen wurden, können eine Rückerstattung erhalten. Kunden, deren Buchungen bis einschließlich 13. Juni getätigt wurden und die Tickets für Abflüge bis einschließlich dem 28. Juni besitzen, können ihre Flüge zu stornieren und ihre Tickets in eine Gutschrift für eine zukünftige Nutzung umwandeln.
Darüber hinaus sind EL-AL-Flüge, deren Abflug bis einschließlich dem 30. Juni geplant ist, derzeit für neue Buchungen in den Buchungssystemen gesperrt. Passagieren, deren Flüge für Samstagabend, den 14. Juni, oder Sonntag, den 15. Juni, geplant sind, wird geraten, nicht zum Flughafen zu kommen, sondern auf Updates bezüglich ihres Flugstatus zu warten.